Fakultas Pertanian didirikan pada tanggal 20 Mei 1963
bersamaan dengan perubahan Universitas Daya Nasional manjadi Universitas Negeri Pontianak (UNEP)
yang ditetapkan dengan surat keputusan Menteri PTIP Nomor : 53 tahun 1963
tanggal 16 Mei 1963. Pada tahun 1965 UNEP berubah menjadi Universitas DWIKORA
yang ditetapkan dengan Surat Keputusan Presiden RI Nomor : 278 Tahun 1965
tanggal 14 September 1965. Pada tanggal 15 Agustus 1967 nama Universitas
Dwikora di tetapkan menjadi Universitas Tanjungpura di singkat UNTAN dengan
surat kepusan Presiden RI. Nomor :171 tahun 1967. Sebagai pelopor pendiri
Fakultas pertanian adalah Ir.Soedarso Rawidjo yang menjabat sebagai kepala
dinas pertanian provinsi Kalimantan Barat. Pada tahun 1969 Fakultas Pertanian
berkerja sama dalam bentuk kuliah pelengkap (Affiliasi) dengan Institusi
Pertanian Bogor yang dirintis Drs. Ikin Sabrani (Dekan) dan Ir. Hidayat
Ardiwinata (sekretaris Dekan).
Pada
tahun 1970 dikirim 3 (tiga) orang mahasiswa Affiliasi sebagai angkatan pertama
ke Fakultas pertanian IPB Bogor dari jurusan budidaya pertanian. Mereka yang
dikirim sebelumnya diangkat sebagai dosen tetap, yaitu: Purnamawati, Aminardi
dan Darea. Pada tahun 1973 dikirim 2(dua) orang lagi mahasiswa Affiliasi
angkatan pertama ke Fakultas Kehutanan IPB Bogor. Mereka yang dikirim
sebelumnya diangkat sebagai Dosen tetap, yaitu : Sakunto dan Herujono
Hadisuparto.
Lulusan
pertama sarjana Fakultas Pertanian Universitas Tanjungpura hasil Affiliasi
dengan Fakultas Pertanian Bogor pada tahun 1973 dari Jurusan Budidaya
Pertanian, yaitu : Ir. Purnamawati, Ir. Aminardi dan Ir. Darea sedang hasil
Affiliasi dengan Fakultas pertanian Bogor pada tahun 1976 dari Jurusan
Kehutanan, yaitu : Ir. Sakonto dan Ir. Herujono Hadisuparto. Pada tahun 1979,
Fakultas Pertanian UNTAN telah mampu menghasilkan lulusan sarjana sendiri.
Pengiriman mahasiswa Affiliasi dihentikan pada tahun 1981.